Actualmente soy investigadora asociada del Laboratorio de Medicina Genómica en el Hospital Regional Lic. Adolfo López Mateos, ISSSTE cuenta con una tecnología variada, de alta calidad y alto rendimiento para el procesamiento de muestras de las Cohortes.
Sistema EP1 TM Fluidigm Co
Sistema Gene TitanTM Thermo Fisher
Secuenciador
Integrigen de México SAPI de CV fue la empresa y laboratorio que desarrollamos junto a emprendedores preocupados por la obesidad infantil para la implementación del proyecto Por tu salud. Procesamos 10000 muestras en el laboratorio de 4 meses.
Para la genotificación usamos el sistema Juno de Fluidigm Co. Juno permite más aplicaciones que el sistema EP1™ como la preparación de bibliotecas de secuenciación de próxima generación, análisis de expresión génica y genotipado mediante PCR para alelos específicos.
Para la extracción de ADN usamos la tecnología de Hamilton, la línea Microlab Start que es una plataforma automatizada. La tecnología de pipeteo de esta línea logra una alta precisión y repetibilidad desde microlitros hasta grandes volúmenes. A su vez logra muy buena calidad del ADN para luego amplificarlo por sistemas de nano fluidos como el de Fluidigm
El Laboratorio Metric Sport City SA de CV fue instalado en 2012 bajo mi dirección y continúa trabajando en la actualidad. En mi período de trabajo hasta el 2016 realizamos 40.000 pruebas genéticas.
La tecnología que usamos genotipificación es el equipo EP1™ de Fluidigm Co.
EP1es un sistema eficiente de genotipado de alto rendimiento de SNPs y otras aplicaciones de PCR de punto final. La tecnología de Fluidigm, se basada en un circuito de nanofluidos. Este sistema permite trabajar con muy poco volumen de muestra y a su vez realizar un elevado número de determinaciones en muy poco tiempo. Permite costos de operación bajos y proporciona un flujo de trabajo muy sencillo.
La cohorte COIPIS (cohorte de obesidad infantil del proyecto Infancia saludable) comenzó en 2012 en respuesta a la necesidad de establecer un estudio epidemiológico prospectivo de obesidad infantil. Los participantes son niños de 3 a 17 años de edad y son examinados cada 6 meses desde que son reclutados hasta que cumplen 17 años. Los padres de los participantes son invitados entre los maestros titulares derecho habientes del ISSSTE que también miembros del sindicato y pacientes.
Resultados principales
Contribución
Mostramos que la prevalencia de obesidad infantil, escolar y adolescente esta subestimada a partir de su estimación por IMC.
Sugerimos cambiar los puntos de corte de la clasificación de sobrepeso y obesidad por IMC; considerando los valores en el percentil 75 como sobrepeso y los valores en el percentil 85 como obesidad, coincidiendo con recomendaciones anteriores para niños mexicanos.
El Proyecto Por tu salud fue creado para proponer e implementar soluciones en relación a la obesidad infantil en México. Fue implementado en escuelas públicas utilizando u distintas estrategias como la intervención en alimentación, actividad física, educación de la salud y participación de los padres. Para la evaluación del proyecto medimos composición y condición física, variables clínicas y variable genéticas.
Por tu salud se implementó en: escuelas generales de Hermosillo, en las comunidades indígenas Seri y Yaquis, en Sonora, y en escuelas generales e indígenas de lengua Náhuatl en Puebla. Trabajamos con 10000 niños.
Resultados principales:
Los niños urbanos de Sonora presentaron la prevalencia más alta de sobrepeso y obesidad (47.4%) y niños de Puebla (31.5%).
Genómica
Intervención
Condición Física
Contribución
Este tipo de intervención a nivel escolar podría contribuir con la solución de la obesidad infantil a corto, mediano y largo plazo.
El Proyecto Metric de Sport City SA de CV, surge de una investigación en la propia empresa cuyo objetivo fue analizar la variación genética individual en relación a predictores de enfermedades metabólicas y a la condición física.
Específicamente realizamos análisis de asociación entre componentes genéticos en el índice de masa corporal (IMC), porcentaje de grasa y circunferencia de cintura, variables clínicas (predictores de enfermedades cardiovasculares y de diabetes) y de la condición física (capacidad aeróbica y fuerza resistencia). Este trabajo lo realizamos en individuos con y sin obesidad que practicaban ejercicio físico no competitivo de la población de la Ciudad de México.
Resultados principales
Contribución
Encontramos variables genéticas que son responsables de la variación de proteínas que participan de rutas metabólicas involucradas en la obesidad y diabetes. Y así mismo variables que pueden ser modificadas por nuestro estilo de vida, ayudan a atenuar el riesgo genético.
Los resultados nos ayudaron a comprender por qué a la misma intensidad de ejercicio o los mismos valores de fuerza o de capacidad aeróbica, no tienen el mismo efecto sobre el IMC personas. Estas diferencias pueden explicarse, en parte, por la variación genética individual
